Pendidikan bukan hanya menekankan pada aspek kognitif, namun yang yang tidak kalah penting adalah pada aspek afektif dan psikomotorik. Apabila ketiga aspek ini bisa terjangkau tentunya akan tercipta peserta didik yang berkarakter yang kuat dan cerdas. ESTIB-SMPN 3 Bayat Klaten selalu memberikan pendidikan yang berbasis karakter. Sebagai contoh dalam memperingati hari besar agama Islam Idhul Adha, siswa melaksanakan kemah Ilmiah pada tanggal 27 - 28 Oktober 2012. Kemah ilmiah ini dilaksanakan kegiatan-kegiatan bersamaan denga Hari Raya Idhul Andha antara lain pengajian akbar, penyembelihan hewan korban seekor lembu, seminar ilmiah, game ilmiah, penelitian hewan korban, pentas seni, lomba memasak dan pengabdian masyarakat
